Die Kosten und die Finanzierung der Expo.01 resp. Expo.02 blieben bis zum Rückbau ein grosses Thema.

Der Bericht der Geschäftsprüfungskommission des Ständerates vom 27.03.2001 beschreibt die Probleme bei der Vorbereitung und Organisation der Landesausstellung (Expo.01) insbesondere bei den Kosten und der Finanzierung wie folgt:

Die finanziellen Schwierigkeiten der Expo.01 hingen im Wesentlichen mit dem gewählten Konzept zusammen. Die Details der Ausstellung sollten auf kreative, dynamische Art im Laufe der Zeit entwickelt werden. Auch die Infrastrukturprojekte befanden sich in einer Entwicklungs- und Auswahlphase. Geplant wurde nach der Methode des Simultaneous Engineering, d.h., die Projekte wurden von den Direktionen parallel und nicht auf einer Zeitachse entwickelt. Auch bei den Einnahmen fehlten zuverlässige Angaben über die Bereitschaft privater Geldgeber und die zu erwartenden Eintrittsgelder. Unter diesen Voraussetzungen war natürlich eine zuverlässige Budgetierung in der ersten Phase nicht möglich. Der tatsächliche Finanzbedarf ergab sich erst mit der Konkretisierung der Ausstellung. Im Oktober 1998 erfuhr das Büro des Strategischen Ausschusses, dass Sponsoringbeiträge von 300 Millionen Franken notwendig sind (zugesichert waren erst 175 Millionen, die meisten durch Absichtserklärungen). Hier war man zum ersten Mal erstaunt, dass die Zahlen am Anfang nicht präziser eruiert werden konnten. 

Gemäss Einschätzung der Eidgenössischen Finanzkontrolle dürfte aus heutiger Sicht in der Zeit des Meilensteins von Ende April 1999 erstmals ein vertretbarer Überblick über die finanzielle Situation möglich gewesen sein. Tatsächlich, aber auch nicht definitiv, wurde der Finanzbedarf mit der Standortbestimmung von Hayek Engineering im September 1999 geklärt. Auch wenn heute, d.h. bei Expo.02, der Finanzbedarf einigermassen überblickt werden kann, bestehen nach wie vor Unsicherheiten, vor allem bedingt durch die ungewissen Einnahmen. Dieses von der Politik gewählte und vom Verein konkretisierte Konzept stellte wegen der unklaren Einnahmen und Ausgaben an die finanzielle Abwicklung besondere Anforderungen, denen das Management mangels einschlägiger Erfahrung nicht zu genügen vermochte. 

^{Aus dem Bericht der Geschäftsprüfungskommission des Ständerates vom 27.03.2001- Probleme bei der Vorbereitung und Organisation der Landesausstellung 2001 (Expo.01)}