Durant la phase de déconstruction, l'armée avait également mis à disposition un certain nombre de militaires. Au total, 4 bataillons de génie (2 bataillons en novembre et décembre 2002 et 2 bataillons entre février et juin 2003) ont été impliqués dans la phase de démantèlement.

Ces formations ont notamment été engagées pour le démantèlement des installations du Département fédéral de la défense, de la protection de la population et des sports (DDPS) sur l'arteplage de Morat-Morat à Meyriez, pour les projets d'exposition de la Confédération (chantier naval sur l'arteplage de Morat-Morat et Palais de l'Equilibre sur l'arteplage de Neuchâtel), pour le projet d'exposition Circuit de l'Office fédéral du sport sur l'arteplage d'Yverdon-les-Bains, ainsi que pour diverses constructions au profit de la direction d'Expo.02.

Arteplage Neuchâtel 
Plateformes de restaurants, passerelles, embarcadère de l'Arteplage Mobile du Jura, ...

Arteplage Yverdon-les-Bains
Déconstruction de l'extension de la jetée, ...

Les travaux de déconstruction des formations du génie ont représenté environ 6'000 hommes-jours.

Phase de déconstruction Expo.02 

Bataillons du génie (novembre et décembre 2002) 
2 bataillons
1'000 membres de l'Armée suisse
2'500 hommes-jours

Bataillons du génie (février à juin 2003)
2 bataillons
1'000 membres de l'Armée suisse
3'500 hommes-jours

^{Photos: © Archives Frédérique Mouchet}